a. Laboratorium Kimia

Kadar air,Kadar Abu, Kadar Protein, Kadar Lemak, Kadar Garam, Karbohidrat, Serat kasar, TVB, TMA, Fenol, Angka peroksida, Sulfat, Abu tak larut asam, Angka iod, Asam lemak bebas, Bilangan tak tersabunkan, Indeks bias, Berat jenis, Salinitas, COD, BOD, Amonia, Phospat, Nitrit, Nitrat, Sulfit, Histamin, Logam pada air (Hg, Pb, Cd, Cu, Zn, Fe), Logam pada sedimen (Hg, PB, Cd, Cu, Zn, Fe), Formalin (kualitatif/kuantitatif), pH, Rendemen (Alginat, Karaginan, Agar), Titik Jendal, Titik leleh, Gula reduksi, Urea, Asam Lemak (polar & non polar), Klorofil, Sifat Phisik Rheologi (RVA), Kualitas produk rumput laut (karaginan, agar, alginat), Pengotor/Benda asing, KCL Gel strength, Water Gel strength, Viscositas, CAW, Derajat putih.

b. Laboratorium Mikrobiologi

Total Plate Count (TPC), Bakteri Halophilik, Coliform/E. coli, Vibrio parahaemolyticuus, Salmonella, Staphylococcus aureus, Jamur/kapang, Yeast/khamir, Bakteri Pembentuk Asam Laktat, Identifikasi Jamur/kapang, Bakteri Pembentuk Histamin.

c. Laboratorium Bioteknologi

Aktivitas Protease, Aktivitas Kitosanase, Aktivitas Kitinase, Ekstraksi DNA, Amplifikasi DNA, Purifikasi produk PCR, Uji Protein terlarut, Uji Sitotoksik, Metode MTT, Uji Sitotoksik, Metode BSLT, Uji antibakteri, Elektroforesis, Uji antioksidan Sonikasi pemecah dinding sel, Sentrifugasi, Pemekatan Enzim, Homogenisasi jaringan, Deionisasi air.

d. Laboratorium Instrumentasi

Pengeringan (Rotavaporasi/N2 Evaporasi), Pemisahan Kromatografi/Spektra Fragmentasi, Kromatografi/Separasi, Kromatografi/Spektra, Fragmentasi, Spektroskopi, Derajat Deasetilasi, Sonikasi, Kromatrografi lapis tipis, Analisis Asam Amino dan Asam Lemak.

e. Laboratorium Fisik dan Pengolahan Produk

Grinder (uk.40-100 mesh)/kg, Cold Storage, Pengolahan meat based produk (Surimi, Bakso, Sosis), Meat stirer, Alat pencincang daging, Pengolahan produk rumput laut, Pengolahan limbah perikanan (penyamakan kulit ikan, kitosan, gelatin).

f. Laboratorium Sensori

Uji Penerimaan (Acceptance test), Uji Pembedaan (Difference Test), Uji Deskriptif (Panelis Terlatih), Consumer Test (Panelis Tidak Terlatih).

g. Laboratorium Bioassay

Uji Toksisitas akut/sub kronis, Analisis kimia darah, Kolestrol uric acid, Creatinine, GPT/ALT, GOT/AST.

h. Laboratorium Mekanisasi Proses

Pembuatan alat pengolahan rumput laut, generator asap cair, peti berinsulasi palka untuk kapal penangkap ikan, pengering ikan, pengasap ikan, penepung ikan, peralatan penanganan dan pengolahan kulit ikan.

i.   Laboratorium Data

Menyediakan Fasilitas internet hotspot Wifi, online website, data gizi ikan, jurnal penelitian perikanan , fasilitas ruang rapat, multimedia dan dokumentasi.